Антистрессовые и антимутагенные свойства пропионовокислых бактерий
Содержание
Содержание
Список сокращений...5
Введение...7
1. Обзор литературы...10
1.1 Пропиновокислые бактерии...10
1.1.1 Классификация...10
1.1.2 Общая характеристика классических пропионовокислых бактерий...11
1.1.3 Морфология...12
1.1.4 Анатомия...13
1.1.5 Питательныевые потребности...13
1.1.6 Брожение, осуществляемое пропионовокислыми бактериями...13
1.1.7 Синтез витамина Bi2...16
1.1.8 Применение пропионовокислых бактерий...18
1.2 Мутагены и мутагенез. Классификация мутагенов...18
1.3 Антимутагенез. Классификация антимутагенов...23
1.3.1 Свойства и критерии оценки антимутагенов...27
1.3.2 Бактериальный антимутагенез - новое важное направление в микробиологии...29
1.4 Антимутагенные свойства бактерий...30
1.4.1 Антимутагенные свойства молочнокислых и бифидобактерий...30
1.4.2 Антимутагенез пропионовокислых бактерий...32
1.5 Методы определения мутагенных и антимутагенных свойств химических соединений...34
1.6 Стрессы и регуляция стрессовых ответов...36
1.6.1 Системы сигнализации...36
1.6.2 Перекрывание антисрессовых ответов...37
1.6.3 Молекулярные шапероны...37
1.7 Тепловой шок...38
1.8 Низкотемпературный шок...41
1.9 Кислотный шок... ..42
1.10 Окислительный стресс...45
1.11 Осмотический шок...50
2. Экспериментальная часть...54
2.1 Материалы...54
2
2.1.1 Реактивы...54
2.1.2 Буферные системы...55
2.1.3 Сорбенты...56
2.1.4 Среда для выращивания пропионовокислых бактерий, способствующая включению радиоактивных аминокислот...56
2.1.5 Рабочая субстанция...56
2.1.6 Приборы и оборудование...57
2.1.7 Источники мутагенов...57
2.1.8 Подготовка микросомальной активирующей смеси (S-9 mix)...61
2.1.9 Источники антимутагенов...61
2.1.10 Тест-культуры...62
2.1.11 Условия роста культур...62
2.1.12 Растворы используемые для постановки теста Эймса...63
2.2 Методы...64
2.2.1 Фракционирование клеточного экстракта сульфатом аммония...64
2.2.2 Обработка растворов сульфатных фракций PMSF...64
2.2.3 Концентрирование белкового раствора (1)...64
2.2.4 Концентрирование белкового раствора перед электрофорезом (2)...64
2.2.5 Электрофорез...64
2.2.6 Двумерный электрофорез...65
2.2.7 Введение радиоактивной метки...65
2.2.8 Хроматографические методы...66
2.2.9 Определение аминокислотной последовательности белка с N-терминального участка молекулы...66
2.2.10 Определение концентрации белка и содержания нуклеиновых кислот...67
2.2.11 Определение гомогенности препаратов методом ВЭЖХ...67
2.2.12 Определение молекулярной массы белков...67
2.2.13 Определение биологической активности белковых фракций...67
2.2.14 Постановка модифицированного теста Эймса с использованием индикаторных штаммов Salmonella typhimurium...69
3. Результаты...72
3.1 Защитные и реактивирующие свойства пропионовокислых бактерий...72
3.1.1 Фракционирование на DEAE-сефарозе...72
3.1.2 Гель-фильтрация на сорбенте G-75...75
3.1.3 Изучение физико-химических характеристик очищенного белкового препарата...77
3.1.4 Изучение зависимости протекторной активности белка от его концентрации в отношении клеток
Е. coli, инактивированных УФ-светом...80
3.1.5 Изучение реактивирующего эффекта белка в отношении действия желчных кислот и теплового
стресса...81
3.2 Антимутагенные свойства пропионовокислых бактерий»...82
3.2.1 Проверка генотипа тест-штамма...83
3.2.2 Исследование влияния компонентов сред на антимутагенную активность бактерий, используемых для их выращивания...85
3.2.3 Изучение влияния различных факторов на АМ-активность бактерий...85
а) Исследование АМ-эфекта в зависимости от возраста исследуемых культур...88
б) Изучение влияния концентрации микросомальной активирующей смеси на выражение АМ-эффекта .. ..88
в) Изучение влияния типа регистрируемой мутации на выражение АМ-эффекта...92
3.2.4 Антимутагенные свойства пропионовокислых бактерий...94
а) Скрининг штаммов пропионовокислых бактерий в связи с их антимутагенной активностью...94
б) Антимутагенное действие культуральной жидкости и клеток в отношении мутагенеза, индуцируемого азидом натрия...96
в) Антимутагенное действие культуральной жидкости и клеток в отношении мутагенеза, индуцируемого 2-НФ...97
г) Антимутагенное действие культуральной жидкости и клеток в отношении мутагенеза, индуцируемого 4-НХО...98
д) Антимутагенный эффект культуральной жидкости и клеток P. freudenreichii subsp. shermanii KM 103 и P.freudenreichii subsp. freudenreichii KM 133 в отношении мутагенеза, индуцируемого Н2О2, ВАР, PhiP ...99 з) Антимутагенный эффект культуральной жидкости и клеток P. freudenreichii subsp. shermanii KM 103 в отношении мутагенеза, индуцируемого МННГ и9-АА...106
3.3.3 Исследование механизма АМ-действия эффект культуральной жидкости и клеток P.freudenreichii subsp. shermanii KM 103 вотношении мутагенов, индуцирующих мутации замены пар оснований у тестерного штамма S. typhimurium ТА 100...107
3.3.4 Изучение влияния нагревания, диализа и протеолиза на антимутагенное действие культуральной жидкостиР. freudenreichii subsp. shermanii KM 103 и Р. freudenreichii subsp. freudenreichiiKM 133...108
3.3.5 Изучение АМ-свойств представителей другигих видов бактерий...110
4. Обсуждение результатов...113
4.1 Антистрессовые свойства пропионовокислых бактерий...113
4.2 Антимутагенные свойства пропионовокислых бактерий...115
Выводы...120
Список литературы...121
Выдержки из работы:
Большинство химических мутагенов, являются веществами, чужеродными для организма (ксенобиотиками). Попадая в организм, преодолев покровные ткани, мутаген должен быть доставлен к клеткам-мишеням, в которых он может вызывать мутации. На: всем пути проникновения мутаген претерпевает целый комплекс метаболических превращений, приводящих к образованию как более, так и менее биологически активных метаболитов, по сравнению с исходными веществами. В' первом случае, когда из биологически малоактивных веществ в организме могут образовываться высокотоксичные соединения, индуцирующие мутагенез, или другие биологические эффекты, говорят о метаболической активации. Мутагены, нуждающиеся в подобной активации, называют непрямыми. Метаболическая активация; это ферментативный процесс, который эволюционно сформировался как: система детоксикации ксенобиотиков, попадающих в организм (Абилев, 1986). Эта система представляет собой многоступенчатый процесс, включающий комплекс ферментов, которые вначале окисляют вещество, переводя его в высокоактивные соединения, а затем, соединяя их друг с другом или с другими веществами, превращают в безвредные, легко выводимые из организма. На первом этапе детоксикации особая роль принадлежит монооксигеназам смешанных функций, локализованных в эндоплазматическом ретикулюме (ЭПР). При чрезмерном поступлении, ксенобиотиков в организм, изменении активности монооксигеназ смешанных функций, нарушении работы ферментов, осуществляющих
второй этап детоксикации, может произойти сбой в работе системы, заключающийся в нарушении равновесия между процессами первого и второго этапов. И тогда высокоактивные метаболиты (эпоксиды, свободные радикалы, хиноны), не успев разрушиться; взаимодействуют с ДНК, вызывая ее мутационные изменения. Прямые мутагены не нуждаются в метаболической активации, но являясь ксенобиотиками, также подвергаются, в организме воздействию монооксигеназной системы и, в частности цитохрома Р-450. Но в данном случае система работает по своему прямому назначению, то есть осуществляет детоксикацию и таким образом снижает выход мутаций. (Порошенко, Абилев, 1988).
Нитрофураны, нитроимидазолы, продукты пиролиза белков и ¦. другие химические соединения, превращаются в высокореакционноспособные вещества при восстановлении. Поэтому при определении их мутагенности" для метаболической активации; используют фракцию S9 печени; крыс, так как она проявляет нитроредуктазную активность. Восстановление нитрогрупп в печени млекопитающих обусловлено действием таких ферментов, как НАДФН-цитохром С-редуктаза, ксантиноксидаза и адьдегидоксидаза; (Шарма, 1989). Реакции, катализируемые монооксигеназной системой, включают ароматическое: или алифатическое гидроксилирование, образование окислов аренов и алкенов, окислительное N-, О- и - S-деалкилирование, окислительное дезаминирование,. десульфилирование и дегалогенирирование (Арчаков, 1975).
Завершающим этапом активации соединений может быть синтез коньюгатов. В организме млекопитающих многие активные метаболиты образуют коньюгаты с глюкуроновой кислотой, ацетилом, сульфатом, глицином, и в таком состоянии выводятся из печени i с желчью. Но в кишечнике коньюгаты под действием микробиоты расщепляются. И мутагенный агент может быть реабсорбирован (Абилев, 1986).
Как прямые мутагены, так и продукты метаболической активации промутагенов, достигнув ДНК в клеточном ядре, вызывают в ней первичные изменения (табл. 1.3) • (Порошенко, Абилев, 1986), которые могут реализоваться в истинные мутации или быть полностью устранены. Судьба этих первичных изменений; ДНК зависит от работы ферментных систем репарации ДНК, функционирующих в каждой клетке.
Точная репарация первоначальной структуры ДНК практически > не - оказывает влияния ; на функционирование биологической системы. Наличие нерепарированных участков в ДНК или ошибочная репарация приводят к нарушениям многих физиологических процессов. Например, при этом происходят нарушения роста и деления клеток, наблюдаются ошибки в механизмах репликации, транскрипции, увеличиваются злокачественная трансформация клеток и смертность.
В животных клетках различают четыре основных типа репарации ДНК: эксцизионная или дорепликативная репарация, репарация разрывов нитей ДНК, пострепликативная репарация и фотореактивация. Первые три могут индуцироваться многими факторами, в то время как фотореактивация - только УФ-лучами. Состояние клеточного цикла (G 1 или S) и степень дифференцировки данной ткани являются главными факторами, определяющими интенсивность и механизм репарации.
1.3 Антимутагенез. Классификация антимутагеновВ природе существуют механизмы, противодействующие росту числа мутаций, как за счет выщепления и гибели мутантных особей, а также и препятствуя появлению
новых мутаций; Это так называемые процессы антимутагенеза. К механизмамам обеспечивающим антимутагенез нужно отнести двойную * структуру спирали ДНК, процессы репарации повреждений ДНК, процессы связывания и дезактивации, особенно активных продуктов! метаболизма ксенобиотиков, механизмы, регулирующие скорость процессов, метаболической активации: мутагенов, и: процессы, затрудняющие прохождение мутагенов через клеточные мембраны. В ряде случаев имеет место прямое связывание мутагена с антимутагенным"соединением и последующим выведением из организма такого комплекса.
Ингибирование процессов, формирующих спонтанные и индуцированные ¦ мутации^ называют антимутагенезом, а вещества, обладающие такими свойствами; известны как антимутагены (Шигаева, Ахматулина, 1988). Явление антимутагенеза впервые установлено в 1952 -1959 гг., когда была показана способность пуриновьгх нуклеотидов эффективно снижать уровни спонтанного и индуцированного мутирования в экспериментах паЕ. coli (Дурнев, Середенин, 1993; Novick, Szilard, 1952).
Антимутагенез как генетический процесс присущ всем живым организмам; И нет сомнения в том, что процесс этот естественный, тем более, что большинство выявленных антимутагенов - природные вещества. Функцией антимутагенеза; является обеспечение целостности и стабильности наследственных структур (Алекперов, 1984).
В 1986 году Kada Т. и др. дали следующие определения для обозначения факторов, осуществляющих процессы инактивации i мутагенов и устранения повреждений, нанесенных ими;
Дисмутагены - вещества, которые осуществляют химические, физические и биохимические модификации мутагена вне клетки до повреждения ДНК. Дисмутагены включают восстановительные агенты, антиоксиданты, процессы дисмутагенеза могут быть связаны с энзиматическими модификациями, прямой* адсорбцией мутагена. Некоторые антимутагены могут ингибировать метаболическую активацию промутагенов, проявляя опосредованное подавление мутаций.
Биоантимутагены снижают частоту мутаций, взаимодействуя с клеткой и процессами в ней уже после фиксации мутаций. Они г связывают биологически активные радикалы, возникающие в ходе таких превращений мутагена, залечивают первичные нарушения1 в генетических структурах и не позволяют реализоваться им в истинные мутации, а также затрудняют проникновение мутагена в
Более подробные данные по классификации антимутагенов представлены в таблице 1.4 (Heller and Sevag, 1966; Hayatsu et al., 1988; Hochstein, Atallah, 1988; Hocman, 1988; Kuroda, Inoue, 1988; Musatov, Anisimov et al., 1998; Порошенко, Абилев, 1988; Bala, Grover, 1989).
При комбинированном применении действие ингибиторов мутагенеза носит синергический, аддитивный или антагонический характер. Например, синергизм проявляется при использовании витаминов С и Е; действие витамина Е необходимо для протектекции витамина А. Более того, витамин Е действует аддитивно с соединениями селена (Засухина, Синелыцикова, 1993).
* Примечание. Некоторые антимутагены характеризуются более чем одним механизмом действия.
Итак, существуют следующие основные пути действия антимутагенов: нейтрализация мутагена до его взаимодействия с ДНК; предотвращение образования в процессе метаболической; активации мутагенных продуктов из нетоксичных предшественников; активация ферментных систем детоксикации, поступающих из среды загрязнителей; предотвращение в процессе репликации ДНК; активация репарации и других внутриклеточных систем поддержания целостности генетического аппарата (De Flora and Ramel; 1988).
Хотя обнаружено более 300 веществ, обладающих антимутагенными свойствами, однако большинство из них изучено на ограниченном числе объектов, что затрудняет их; комплексную оценку. Тем не менее, определенные закономерности выявлены. Наиболее перспективны природные антимутагены, выделенные из различных видов растений ю животных. Они, вероятно, и будут в ближайшем будущем необходимым элементом как в профилактических мероприятиях, направленных на снижение генетических последствий антропогенных воздействий, так ш при? необходимости коррекции химиотерапии, у онкологических больных, а также при лечении ряда заболеваний, этиопатогенез которых связан с: нарушением'клеточного гомеостаза, вызванного дефектом в системе защиты клеток.
1.3,1 Свойства и критерии оценки антимутагеновПри-исследовании новых антимутагенов необходимо изучить пути и механизмы; их действия. Определить способ практического использования. Для; успешного
Общим для всех антимутагенов является лишь частичное подавление мутагенеза, что в равной; мере относится: и к индуцированному мутагенезу. По степени ингибирования они довольно сильно отличаются друг от друга. Известны соединения, уменьшающие частоту мутантов на 80 и более процентов, в то время как другие - только на 20. Этот критерий предлагается использовать для определения относительной эффективности антимутагенов. Существуют два способа оценки эффективности. Первый способ предусматривает сопоставление концентраций антимутагенов, обеспечивающих уменьшение мутаций на 50%. В этом случае, чем ниже концентрация, уменьшающая наполовину мутабельность, тем эффективнее антимутаген. Вторым
способом оценивают эффективность антимутагенов по показателю отношения разницы между частотами спонтанных (исходных) и модифицированных мутаций к исходному уровню мутабельности.
Исследования показали, что действие некоторых антимутагенов избирательно -они действуют, например, на индуцированный мутагенез и не влияют на спонтанный (Порошенко, Абилев, 1988). Одни эффективны только по отношению к абберациям хромосом, другие - к генным мутациям. Известны также антимутагены, подавляющие активность только непрямых мутагенов, например катехин и ретинол. В то же время другие антимутагены больше действуют на прямые мутагены, а для подаления действия непрямых мутагенов требуются во много раз большие их концентрации. Большинтство антимутагенов обладает широким спектром действия, подавляя мутагенез , индуцированный! разными мутагенами, т.е. они универсальны. В связи с этим введено понятие индекса универасльности,за еденицу которого принимают антимутагенный эффект по каждому из мутационных тестов на разных типах объектов в условиях индукции мутаций факторами разной природы. Наиболее высокие индексы универсальности свойственны таким веществам, как аскорбиновая кислота, селенит натрия, токоферол и др. Они подавляют мутабельность бактерий, грибов, высших растений, лейкоцитов человека и животных.
Еще одна важная характеристика антимутагенов используется для оценки эффекта высоких доз препаратов. Это физиологичность их действия, отсутствие которой резко ¦ ограничивает перспективу некоторых соединений. Значение данной характеристики= можно прокомментировать емкой мыслью Парацельса: "Все есть яд и все есть лекарство! - решает лишь доза."
Среди изученных антимутагенов одни вещества были известны ранее в качестве мутагенов, другие, не числящиеся в списках мутагенов, оказались таковыми при испытании в высоких концентрациях. Это типично для аргинина, глутаминовой кислоты, стрептомицина, селенита натрия и др. Например, в связи с наличием доказательств того, что витамин А в высоких дозах может вызывать врожденные уродства у плода, органы здравоохранения Великобритании предупреждают женщин об опасности самолечения витамином А в период беременности. Эти предупреждения также относятся к любым видам пищевых добавок, содержащих витамин А, а также к препаратам рыбьего жира. Третьи антимутагенные вещества не токсичны и не мутагенны даже в больших дозах.
- Покоящиеся формы Бактерий рода Mycobacterium: получение, Биохимические факторы реактивации
Было отмечено, что при переходе Mycobacterium bovis в "некультивируемое" состояние наблюдается активизация синтезов ос-кристаллина. а-кристаллин является не большим (20-кДа) белком теплового шока. Он относится к шаперонам и играет важную роль в процессе выживания клеток при неблагоприятных условиях [Yuan, 1996] . - Миколитические ферменты Бактерий Bacillus Cohn и ик роль в антагонизме к почвенным микромицетам
В соответствии с рекомендациями Комитета по номенклатуре ШВМВ в 1978 г. обо^ значение КФ 3.2.1.29 удалено, и этот фермент объединен с P-N-ацетилглюкозаминидазой; 3По рекомендации Комитета по номенклатуре ШВМВ в 1992 г. КФ 3.2.130 удален, и фермент P-N-ацетилглюкозаминидаза был объединен с P-N-гексозаминидазой ф-N-D-гексозаимнид N-гексозаминогидролаза, КФ 3. - Роль антиоксидантнык систем в ответе Бактерий Escherichia coli на действие антибиотиков и ацетамидофенола
- Разработка нового проБиотика на основе Бактерий видов Lactobacillus plantarum и bacillus subtilis
Микроорганизмы в составе пробиотиков должны сохранять основные биологические свойства в течение не менее одного года при температуре не выше 8°С. Более предпочтительными считаются бактерии-продуценты, способные сохраняться при температуре не выше 30°С в течение двух - трех лет. - Таксономия и метаболизм новых термофильных и галофильной сульфатвосстанавливающих бактерий, выделенных из месторождений углеводородов
- Компьютерный поиск резуляторнын сайтов Белок-дезоксириБонуклеиновозо взаимодействия в зеномак Бактерий и его приложения
- Распространение сульфатредуцирующих Бактерий и их функционирование в донных отложениях континентальных водоемов разного типа
- Получение штамма — суперпродуцента нейтральной протеазы из Бактерий рода Bacillus и разработка промышленного способа его культивирования
Большое число исследований посвящено выявлению и описанию морфологической дифференциации у бацилл. Bond (1975), выращивая бациллы на агаре с мясным экстрактом, на соевом и глюкозном агаре, наблюдал образование колоний следующих типов: плоские, распростертые, блестящие; плоские, тусклые, слегка морщинистые; округлые, поднимающиеся над агаром, маслянистые; морщинистые с приподнятой складчатостью; ризоидальные. - Влияние экологический условий на распространение и активность бактерий-деструкторов щелочных гидротерм Северо-Восточного Прибайкалья
дали, а содержание кислорода возрастало, потенциал постепенно повышался до +155 мВ. В соответствии В области температур от 20' до 46°С обнаружены цианобактерий Oscillatoria. subcapitata, Synechococcus elongatus, Phormidium valderiae /.medium, а также Synechocystis minuscula и несерные пурпурные бактерии. - Эколого—эволюционная направленность изучения основный отделов растений, Бактерий, грибов и лишайников в школьном курсе Биологии
- Ориентирующие свойства терминов
Исходя из данных "Лингвистического энциклопедического словаря", мы видим, что понимания терминов мотивированность, мотивированный внутри одного этого источника разнятся (хотя связь между этими пониманиями очевидна и нами не оспаривается): мотивированность понимается и как свойство производных слов, и как следствие "живой" внутренней формы слова, и как сумма значений составных частей единицы. - Приговор суда как акт правосудия. Его свойства
1 Муратова Н.Г. Система судебного контроля в уголовном судопроизводстве: Учебное пособие. - Казань: Казанский государственный университет, 2004. С.8.2 Багаутдинов Ф. Отражение публичных и личных интересов в принципах уголовного судопроизводства // Уголовный процесс. - Теоретико—модельные свойства полигонов
- Синтез и свойства эпоксиакрилатных полимеров
Ввиду отсутствия литературных данных по закономерностям фотополимеризации эпоксиакрилатных полимеров, как и в случае вещественного инициирования, данный процесс можно рассмотреть на примере олигоэфиракрилатов. Кинетическая схема фотополимеризации ОЭА включает реакции инициирования, роста, передачи и обрыва цепи (как квадратичный, так и линейный обрыв цепи). - Синтез и свойства 5 , 7-дизаметценнык-4 , 6-динитро5ензофуроксана
ч в бутилфталате, R Ph MeO Me H CI N02 в пара-положении к N3 - 0,535 0,927 1,50 1,80 25,5 в пара-положении к N02 1,78 - 1,67 1,50 - Ускоряющее влияние нитрогруппы в пара-положении к азидогруппе видно также из сравнения констант скоростей термолиз пар нитроазидов (А, Б, В, Г) в расплаве при 100°С [1]: N°2 N02 сТ3 rrN3 ЛС"3 fV3 А Б В Нитроазид А Б В Г К 104, сек'1 21,8 2,2 30,8 17,7 Т °С 55 ПО 66 96 ^^NO2 ^NJO2 O2N-*^^NO2 O2N^^4IO2 г Термораспад Г, изучаемый методами термогравиметрии и дифференциальной сканирующей калориметрии, показал, что энергия активации ниже, чем А.
